Impulsa CICESE capacitación en herramientas de IA aplicadas a la bioinformática

ENSENADA.- Favorecer el uso avanzado de AlphaFold, un programa de Inteligencia Artificial que utiliza el aprendizaje profundo para predecir la estructura tridimensional de las proteínas a partir de sus secuencias de aminoácidos, y cuyos desarrolladores recibieron el Premio Nobel de Química 2024, fue el objetivo de la Cumbre de Educación AlphaFold México 2025, realizada en el CICESE del 1 al 3 de diciembre.

La AFESMX25 (abreviatura de AlphaFold Education Summit México 2025) reunió en Ensenada a 50 participantes de manera presencial y casi 200 en línea, mayoritariamente estudiantes de posgrado e investigadores en biotecnología, ciencias de la computación y ciencias de la vida interesados en aplicar soluciones bioinformáticas innovadoras que faciliten y aceleren sus investigaciones.

En la inauguración, Alexei Licea Navarro, titular de la Dirección de Impulso a la Innovación y Desarrollo e investigador del CICESE, destacó la importancia del encuentro y habló del trabajo colaborativo entre departamentos académicos de esta institución que ha favorecido el impulso del modelado de proteínas y de moléculas, con fines terapéuticos y de diagnóstico.

De manera particular, resaltó la colaboración entre los departamentos de Innovación Biomédica y Ciencias de la Computación, “estamos haciendo una sinergia muy importante y por ello surge esta iniciativa, gracias al doctor Ricardo Gómez Reyes que ha estado al frente de la organización, con el apoyo de los grupos de los laboratorios de inmunología y biotoxinas”.

Durante los tres días de conferencias y talleres, las sesiones se centraron en comprender la biología estructural antes y después de AlphaFold, la teoría, historia y arquitectura del modelo, así como buscar en bases de datos y visualizar estructuras de proteínas, y ejecutar el flujo de trabajo de AlphaFold /ColabFold.

Las conferencias estuvieron a cargo de académicos usuarios de AlphaFold provenientes de instituciones mexicanas: Instituto de Biotecnología de la UNAM, Tecnológico de Monterrey, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, CICESE, y del extranjero: Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, España; Instituto Europeo de Bioinformática, Gran Bretaña; Colegio Bourbaki, Perú y la Universidad de Costa Rica.

La teoría estuvo acompañada de práctica para realizar predicciones con AlphaFold, evaluar sus resultados, entender las limitaciones, emprender mejores prácticas, combinar esta herramienta con otros datos biológicos (multi-ómicos) y simular un proyecto de investigación para planificar y ejecutar el análisis en un contexto real.

Al socializar los avances recientes en IA para el descubrimiento y diseño computacional de péptidos, se espera que los participantes hayan adquirido habilidades y el conocimiento necesario para convertirse en formadores y capacitar a otras personas con el uso de estas herramientas.

En entrevista, Ricardo Gómez, investigador posdoctoral del CICESE, subrayó que el propósito de este encuentro es la necesidad de actualizarse con nuevas herramientas bioinformáticas para hacer investigación e incidir en la industria.

Explicó que la selección de participantes se dio a través de una convocatoria del CICESE que sumó 247 aplicaciones, 50 por ciento de estudiantes de posgrado y el otro porcentaje de catedráticos interesados en actualizarse con este tipo de herramientas.

Gracias al patrocinio de 10 instituciones y corporaciones, y las facilidades técnicas de la Dirección de Telemática del CICESE, los 50 asistentes presenciales y el resto en línea tuvieron acceso al encuentro de manera gatuita.

Este evento es el primero en América Latina y tiene como antecedente el AlphaFold Education Summit 2025, celebrado en enero de este año en Hinxton, Reino Unido.

Ambos encuentros forman parte de una iniciativa internacional para que investigadores y docentes aprovechen el potencial de AlphaFold, desarrollado por DeepMind, de Google , que es de acceso libre, incluye una base de datos con predicciones para cientos de millones de proteínas y está revolucionando investigaciones para el desarrollo de fármacos y la ingeniería de enzimas.